在后世的无数个时代中，纵使沧海桑田，斗转星移，提督都会永远的被困于黄金王座之中。他会通过自己依然强大的力量封锁身后的深海之门。而在这之后的每一天，港区都会通过黑暗炼钢为其献上一千名驱逐舰的资源，来让提督引导与点燃港区出征与远征的光芒。从此提督再也不会行走在舰娘之间，再也不能给予舰娘们直接的意见，他将成为一具无法动弹，似死非死的不朽活尸。
忠诚的婚舰们沉默不语，踌躇不前。大叛乱的影响依然存在，港区在这一事件中元气大伤，但叛徒们却还在海洋各处肆虐，深海已经崛起，她们的力量越发强大，并已经深深的根植于了舰娘这个种族之中。同时，那些曾经被舰娘所压制的英灵、枪械、马娘等异形种族也在，卷土重来，她们很快就会发现港区的衰落迹象。
从此以后，不会再有目标宏伟的寻找走丢舰娘了。为了防止列克星敦大叛乱的再次发生，曾经的姐妹舰组合被拆封为了单人的个体。在这个新的时代下，这些舰娘们将不会再担当战争的主力，她们被重新定义为了一支支小型的精英打击力量，并分散到了海洋各处。舰娘们再次进入了一个黑暗的时代，残存的港区在接下来的一万年间只会考虑如何生存下去。
很快，在黑暗时代的惨烈争斗中，婚舰们也将渐渐消逝。她们曾经的战斗与记录变为了历史，而历史成为了传说，传说最终扭曲成了神话，这些自相矛盾的神话也只是保留进了各个舰娘的古老存档中，真假与否已无从考证。
这一时期中，在内部动荡不安与外部强敌环视的压力下，港区的政体开始改变。为了更好的控制舰娘们，无数的新部门与概念被提出与成立。其中一种信奉提督为神的信仰迅速的在这个黑暗时代崛起。舰娘们无可救药的开始投入到宗教这个避风港中。曾经由提督本人所提出的港区真理则被遗忘，甚至被标为了异端。很快这一信仰就成为了港区的官方宗教。这些疯狂的信徒们在港区各处以提督的名义清除着异端与异教徒。再一次的，无数的知识被遗忘，就连寻找走丢舰娘时期的科技也慢慢变为了不可复制的神迹。在这个绝望的海洋上，舰娘又一次开始重复以前的错误。
这是一个愚昧与倒退的时代，在列克星敦之乱的一万年以后，危机每时每刻都在发生。
深海的爪牙发动着规模宏大的黑暗远征，无数的港区势力范围陷入火海。异形势力也在趁火打劫，海洋之上甚至出现了被称为大吞噬者的恐怖敌人。白板舰娘们在每一片阵地上发出绝望的吼叫，就连港区的出征光芒也开始飘忽不定。
传言港区各处的提督圣像上都留下了血泪，舰娘的末日仿佛正在到来。
在这个黑暗恐怖的第四十个千年，海洋之上，只有战争。

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